Viện Khoa học tổ chức nhà nước là cơ quan thường trực của Hội đồng khoa học Bộ Nội vụ. Hàng năm, Viện đều triển khai kế hoạch nghiên cứu khoa học bảo đảm đúng nguyên tắc, quy trình, chế độ quy định của nhà nước, từ việc xây dựng kế hoạch, đề xuất nhiệm vụ khoa học, công nghệ đến tổ chức triển khai và quản lý, đánh giá, nghiệm thu việc thực hiện nhiệm vụ khoa học, công nghệ.
Trong giai đoạn 2010-2014, các đơn vị thuộc Bộ đã chủ trì thực hiện nhiều Chương trình cấp Bộ, đề tài độc lập cấp nhà nước về những vấn đề cơ bản và cấp bách thuộc phạm vi quản lý của Bộ Nội vụ. Đã tổ chức triển khai và nghiệm thu đề tài “Cơ sở lý luận và thực tiễn xác lập đơn vị hành chính các cấp, đáp ứng yêu cầu ổn định và phát triển đất nước”; “Cơ sở lý luận và thực tiễn đổi mới công tác thi đua khen thưởng trong thời kỳ công nghiệp hóa, hiện đại hóa và hội nhập quốc tế” “Chính sách trọng dụng, khen thưởng và tôn vinh cán bộ khoa học xã hội” và hiện đang triển khai nghiên cứu đề tài “Nghiên cứu thực trạng và đề xuất giải pháp kiện toàn đội ngũ cán bộ, công chức xã, phường, thị trấn và những người hoạt động không chuyên trách ở cấp xã đáp ứng yêu cầu cải cách hành chính nhà nước…”.
Trong giai đoạn 2010-2014, đã tổ chức triển khai 61 đề tài nghiên cứu khoa học cấp Bộ (năm 2011: 12 đề tài, năm 2012: 14 đề tài , năm 2013: 18 đề tài và năm 2014: 17 đề tài). Về cơ bản, các đề tài khoa học cấp Bộ đã đăng ký thực hiện đều mang tính thiết thực cao, phục vụ trực tiếp cho hoạt động quản lý nhà nước của Bộ, ngành như tổ chức bộ máy hành chính nhà nước, chính quyền địa phương, công chức, công vụ, cải cách hành chính, tiền lương, hội và các tổ chức phi chính phủ, văn thư lưu trữ nhà nước.
Đồng thời, các đơn vị thuộc và trực thuộc Bộ đã triển khai thực hiện nhiều chương trình và đề tài nghiên cứu khoa học cấp Bộ như:
– Ban Thi đua Khen thưởng Trung ương đã thực hiện 02 đề tài cấp bộ; Đề án “Đổi mới công tác thi đua, khen thưởng”; Dự án Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Thi đua, Khen thưởng ; tổ chức Hội thảo khoa học: “Đẩy mạnh các phong trào thi đua yêu nước theo tư tưởng Hồ Chí Minh trong thời kỳ đầy mạnh CNH, HĐH và hội nhập quốc tế”; phối hợp với Học viện Chính trị – Hành chính Quốc gia Hồ Chí Minh biên soạn tập bài giảng tập huấn nghiệp vụ thi đua, khen thưởng gồm 6 chuyên đề.
– Ban Tôn giáo Chính phủ đã triển khai 25 dự án, đề án, dự án, trong đó có 18 đề án, dự án đã nghiệm thu, tập trung nghiên cứu về những vấn đề lý luận trong quan hệ nhà nước và giáo hội nói chung; sự vận dụng của Đảng và Nhà nước ta về mối quan hệ giữa Nhà nước và tổ chức tôn giáo phù hợp với từng giai đoạn cách mạng; dự báo tình hình tôn giáo trong những thập kỷ tới, tác động của tình hình thế giới và trong nước đối với tôn giáo Việt Nam; xu hướng quan hệ giữa Nhà nước và tổ chức tôn giáo Việt Nam; nghiên cứu chế độ, chính sách đối với đội ngũ cán bộ làm công tác tôn giáo các cấp…